From 2d7ed527f3c6321398dfdb430cda5d5b0ae17d7b Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: lucile varloteaux <lucile.varloteaux@inrae.fr>
Date: Thu, 16 Jun 2022 16:15:25 +0200
Subject: [PATCH 1/4] =?UTF-8?q?r=C3=A9paration=20affichage=20erreur=20page?=
=?UTF-8?q?=20repository=20(retr=C3=A9=20des=20erreur=20dupliqu=C3=A9)?=
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
Content-Transfer-Encoding: 8bit
---
ui/src/locales/fr.json | 2 +-
ui/src/services/AlertService.js | 116 +++++++++---------
ui/src/services/ErrorsService.js | 15 ++-
.../datatype/DataTypesRepositoryView.vue | 74 +++++++++--
4 files changed, 136 insertions(+), 71 deletions(-)
diff --git a/ui/src/locales/fr.json b/ui/src/locales/fr.json
index 57ffd4f27..f0a356018 100644
--- a/ui/src/locales/fr.json
+++ b/ui/src/locales/fr.json
@@ -117,7 +117,7 @@
"authorizationScopeVariableComponentWrongChecker": "Le composant <code>{component}</code> de la variable <code>{variable}</code> ne peut pas être utilisé comme portant l’information temporelle car ce n’est pas une donnée déclarée comme <code>{expectedChecker}</code>",
"authorizationVariableComponentKeyMissingComponent": "Il faut indiquer le composant de la variable <code>{variable}</code> dans laquelle on recueille les informations spatiales à laquelle rattacher la donnée pour le gestion des droits jeu de données <code>{dataType}</code> pour l'autorisation <code>{authorizationName}</code>. Valeurs possibles <code>{knownComponents}</code>",
"authorizationVariableComponentKeyUnknownComponent": "<code>{component}</code> ne fait pas partie des composants connus pour la variable <code>{variable}</code>. Composants connus : <code>{knownComponents}</code>",
- "badauthorizationscopeforrepository": "L'autorisation <code>{authorization}</code>) doit être <code>{expectedValue}/code> et non <code>{givenValue}</code>",
+ "badauthorizationscopeforrepository": "L'autorisation (<code>{authorization}</code>) doit être <code>{expectedValue}</code> et non <code>{givenValue}</code>",
"checkerExpressionReturnedFalse": "La contrainte suivante n'est pas respectée : <code>{expression}</code>",
"csvBoundToUnknownVariable": "Dans le format CSV, l’entête <code>{header}</code> est lié à la variable <code>{variable}</code> qui n’est pas connue. Variables connues <code>{variables}</code>",
"csvBoundToUnknownVariableComponent": "Dans le format CSV, l’entête <code>{header}</code> est lié à la variable <code>{variable}</code> mais elle n’a pas de composant <code>{component}</code>. Composants connus <code>{components}</code>",
diff --git a/ui/src/services/AlertService.js b/ui/src/services/AlertService.js
index 3b4aada75..e21c81b55 100644
--- a/ui/src/services/AlertService.js
+++ b/ui/src/services/AlertService.js
@@ -1,6 +1,6 @@
-import {i18n} from "@/main";
-import {BuefyTypes} from "@/utils/BuefyUtils";
-import {ToastProgrammatic, DialogProgrammatic} from "buefy";
+import { i18n } from "@/main";
+import { BuefyTypes } from "@/utils/BuefyUtils";
+import { ToastProgrammatic, DialogProgrammatic } from "buefy";
const TOAST_INFO_DURATION = 3000;
const TOAST_ERROR_DURATION = 8000;
@@ -10,66 +10,66 @@ const TOAST_POSITION = "is-top";
* Un service pour gérer les différents messages d'alerte et popup d'info s'affichant sur l'application
*/
export class AlertService {
- static INSTANCE = new AlertService();
+ static INSTANCE = new AlertService();
- toastSuccess(message) {
- ToastProgrammatic.open({
- message: message,
- type: BuefyTypes.SUCCESS,
- duration: TOAST_INFO_DURATION,
- position: TOAST_POSITION,
- });
- }
+ toastSuccess(message) {
+ ToastProgrammatic.open({
+ message: message,
+ type: BuefyTypes.SUCCESS,
+ duration: TOAST_INFO_DURATION,
+ position: TOAST_POSITION,
+ });
+ }
+
+ toastWarn(message, error) {
+ console.warn("[WARNING] " + message, error);
+ ToastProgrammatic.open({
+ message: message,
+ type: BuefyTypes.WARNING,
+ duration: TOAST_ERROR_DURATION,
+ position: TOAST_POSITION,
+ });
+ }
- toastWarn(message, error) {
- console.warn("[WARNING] " + message, error);
+ toastError(message, error) {
+ if (error.content) {
+ error.content.then((t) => {
ToastProgrammatic.open({
- message: message,
- type: BuefyTypes.WARNING,
- duration: TOAST_ERROR_DURATION,
- position: TOAST_POSITION,
+ message: i18n.t("exceptionMessage." + t.message, t.params),
+ type: BuefyTypes.DANGER,
+ duration: TOAST_ERROR_DURATION,
+ position: TOAST_POSITION,
});
+ });
+ } else {
+ ToastProgrammatic.open({
+ message: message,
+ type: BuefyTypes.DANGER,
+ duration: TOAST_ERROR_DURATION,
+ position: TOAST_POSITION,
+ });
}
+ }
- toastError(message, error) {
- if (error.content) {
- error.content.then((t) => {
- ToastProgrammatic.open({
- message: i18n.t('exceptionMessage.' + t.message, t.params),
- type: BuefyTypes.DANGER,
- duration: TOAST_ERROR_DURATION,
- position: TOAST_POSITION,
- });
- })
- } else {
- ToastProgrammatic.open({
- message: message,
- type: BuefyTypes.DANGER,
- duration: TOAST_ERROR_DURATION,
- position: TOAST_POSITION,
- });
- }
+ toastServerError(error) {
+ if (error.content != null) {
+ error.content.then((value) => this.toastError(value.message, error));
+ } else {
+ this.toastError(i18n.t("alert.server-error"), error);
}
+ }
- toastServerError(error) {
- if (error.content != null) {
- error.content.then((value) => this.toastError(value.message, error));
- } else {
- this.toastError(i18n.t("alert.server-error"), error);
- }
- }
-
- dialog(title, message, confirmText, type, onConfirmCb) {
- DialogProgrammatic.confirm({
- title: title,
- message: message,
- confirmText: confirmText,
- type: type,
- hasIcon: true,
- cancelText: this.cancelMsg,
- onConfirm: () => {
- onConfirmCb();
- },
- });
- }
-}
\ No newline at end of file
+ dialog(title, message, confirmText, type, onConfirmCb) {
+ DialogProgrammatic.confirm({
+ title: title,
+ message: message,
+ confirmText: confirmText,
+ type: type,
+ hasIcon: true,
+ cancelText: this.cancelMsg,
+ onConfirm: () => {
+ onConfirmCb();
+ },
+ });
+ }
+}
diff --git a/ui/src/services/ErrorsService.js b/ui/src/services/ErrorsService.js
index 2497aefdd..5ce861953 100644
--- a/ui/src/services/ErrorsService.js
+++ b/ui/src/services/ErrorsService.js
@@ -139,7 +139,18 @@ export class ErrorsService {
const func = ERRORS[csvError.validationCheckResult.message];
if (csvError.validationCheckResult.messageParams.target != null) {
if (csvError.validationCheckResult.messageParams.target.column != null) {
- csvError.validationCheckResult.messageParams.target = csvError.validationCheckResult.messageParams.target.column;
+ csvError.validationCheckResult.messageParams.target =
+ csvError.validationCheckResult.messageParams.target.column;
+ }
+ }
+ if(csvError.validationCheckResult.messageParams.expectedValue != null || csvError.validationCheckResult.messageParams.givenValue != null) {
+ if (csvError.validationCheckResult.messageParams.expectedValue.sql != null) {
+ csvError.validationCheckResult.messageParams.expectedValue =
+ csvError.validationCheckResult.messageParams.expectedValue.sql;
+ }
+ if(csvError.validationCheckResult.messageParams.givenValue.sql != null) {
+ csvError.validationCheckResult.messageParams.givenValue =
+ csvError.validationCheckResult.messageParams.givenValue.sql;
}
}
if (!func) {
@@ -153,4 +164,4 @@ export class ErrorsService {
return func(params);
});
}
-}
\ No newline at end of file
+}
diff --git a/ui/src/views/datatype/DataTypesRepositoryView.vue b/ui/src/views/datatype/DataTypesRepositoryView.vue
index 1af62cef7..816e9c71b 100644
--- a/ui/src/views/datatype/DataTypesRepositoryView.vue
+++ b/ui/src/views/datatype/DataTypesRepositoryView.vue
@@ -191,7 +191,21 @@
{{
currentDataset[0].periode
}}
+ <div v-if="errorsMessages.length" style="margin: 10px">
+ <div v-for="msg in errorsMessages" v-bind:key="msg">
+ <b-message
+ :title="$t('message.data-type-config-error')"
+ type="is-danger"
+ has-icon
+ :aria-close-label="$t('message.close')"
+ class="mt-4 DataTypesManagementView-message"
+ >
+ <span v-html="msg" />
+ </b-message>
+ </div>
+ </div>
</caption>
+
<tr>
<th align>{{ $t("dataTypesRepository.table-file-data-id") }}</th>
<th align>{{ $t("dataTypesRepository.table-file-data-size") }}</th>
@@ -272,6 +286,7 @@ import { Dataset } from "@/model/file/Dataset";
import { InternationalisationService } from "@/services/InternationalisationService";
import { LOCAL_STORAGE_LANG } from "@/services/Fetcher";
import DropDownMenu from "@/components/common/DropDownMenu";
+import {HttpStatusCodes} from "@/utils/HttpUtils";
@Component({
components: { DropDownMenu, CollapsibleTree, PageView, SubMenu },
@@ -305,6 +320,7 @@ export default class DataTypesRepositoryView extends Vue {
endDate = null;
comment = "";
currentDataset = null;
+ errorsMessages = [];
mounted() {
this.$on("authorizationChanged", this.updateDatasets);
@@ -471,29 +487,67 @@ export default class DataTypesRepositoryView extends Vue {
this.file,
fileOrId
);
- console.log(fileOrId);
this.$emit("uploaded", uuid);
}
}
async publish(dataset, pusblished) {
+ this.errorsMessages = [];
dataset.params.published = pusblished;
let requiredauthorizations = dataset.params.binaryFiledataset.requiredauthorizations;
requiredauthorizations = Object.keys(requiredauthorizations).reduce(function (acc, key) {
acc[key] = acc[key] ? acc[key].sql : "";
return acc;
}, requiredauthorizations);
- console.log("requiredauthorizations", requiredauthorizations);
dataset.params.binaryFiledataset.requiredauthorizations = requiredauthorizations;
- console.log("binaryFiledataset", dataset.params.binaryFiledataset);
var fileOrId = new FileOrUUID(dataset.id, dataset.params.binaryFiledataset, pusblished);
- var uuid = await this.dataService.addData(
- this.applicationName,
- this.dataTypeId,
- null,
- fileOrId
- );
- this.$emit("published", uuid.fileId);
+ try {
+ var uuid = await this.dataService.addData(
+ this.applicationName,
+ this.dataTypeId,
+ null,
+ fileOrId
+ );
+ this.$emit("published", uuid.fileId);
+ this.alertService.toastSuccess(this.$t("alert.data-updated"));
+ } catch (error) {
+ this.checkMessageErrors(error);
+ }
+ }
+
+ checkMessageErrors(error) {
+ let message = [];
+ if (error.httpResponseCode === HttpStatusCodes.BAD_REQUEST) {
+ if (error.content != null) {
+ this.errorsList = [];
+ error.content.then((value) => {
+ for (let i = 0; i < value.length; i++) {
+ if (message.length > 0) {
+ if (JSON.stringify(value[i]) !== JSON.stringify(value[i-message.length])) {
+ console.log(message)
+ this.errorsList.push(value[i]);
+ }
+ for(let j = 0; j < message.length; j++) {
+ if (!message.includes(value[i].validationCheckResult.message)) {
+ message.push(value[i].validationCheckResult.message);
+ }
+ }
+ } else {
+ message.push(value[i].validationCheckResult.message);
+ this.errorsList.push(value[i]);
+ }
+ }
+ console.log(this.errorsList)
+ if (this.errorsList.length !== 0) {
+ this.errorsMessages = this.errorsService.getCsvErrorsMessages(this.errorsList);
+ } else {
+ this.errorsMessages = this.errorsService.getErrorsMessages(error);
+ }
+ });
+ }
+ } else {
+ this.alertService.toastServerError(error);
+ }
}
selectAuthorization(key, event) {
--
GitLab
From cffe6c6f8589666ca57884c0e35d91b7e3526405 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: lucile varloteaux <lucile.varloteaux@inrae.fr>
Date: Wed, 22 Jun 2022 15:24:58 +0200
Subject: [PATCH 2/4] =?UTF-8?q?r=C3=A9alisation=20test=20back=20manquant?=
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
Content-Transfer-Encoding: 8bit
---
.../ApplicationConfigurationServiceTest.java | 90 ++++++++-
.../java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java | 50 ++++-
.../oresing/rest/TestReferencesErrors.java | 45 ++++-
.../data/recursivite/recusivite.yaml | 187 +++++++++++++-----
src/test/resources/data/recursivite/sites.csv | 44 +++++
...ons_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv | 17 ++
.../applications/errors/ref_ola_errors.json | 2 +-
7 files changed, 383 insertions(+), 52 deletions(-)
create mode 100644 src/test/resources/data/recursivite/sites.csv
create mode 100644 src/test/resources/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv
diff --git a/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/ApplicationConfigurationServiceTest.java b/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/ApplicationConfigurationServiceTest.java
index f3043cedf..a9ecaad23 100644
--- a/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/ApplicationConfigurationServiceTest.java
+++ b/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/ApplicationConfigurationServiceTest.java
@@ -1111,6 +1111,72 @@ public class ApplicationConfigurationServiceTest {
Assert.assertEquals("timeScopeVariableComponentPatternUnknown", onlyError.getMessage());
}
+ // ne renvois pas d'erreur
+ @Test
+ @Ignore
+ public void testMissingBoundToForConstantDescription() {
+ ConfigurationParsingResult configurationParsingResult = parseYaml("testMissingBoundToForConstantDescription", "format:", "format:\n" +
+ " constants:\n" +
+ " - rowNumber: 1\n" +
+ " columnNumber: 2\n" +
+ " exportHeader: nom du projet");
+ Assert.assertFalse(configurationParsingResult.isValid());
+ ValidationCheckResult onlyError = Iterables.getOnlyElement(configurationParsingResult.getValidationCheckResults());
+ log.debug(onlyError.getMessage());
+ Assert.assertEquals("missingBoundToForConstantDescription", onlyError.getMessage());
+ }
+
+ // ne renvois pas d'erreur
+ @Test
+ @Ignore
+ public void testMissingColumnNumberOrHeaderNameForConstantDescription() {
+ ConfigurationParsingResult configurationParsingResult = parseYaml("testMissingColumnNumberOrHeaderNameForConstantDescription", "format:", "format:\n" +
+ " constants:\n" +
+ " - rowNumber: 1\n" +
+ " boundTo:\n" +
+ " variable: localization\n" +
+ " component: site\n" +
+ " exportHeader: \"Site\"");
+ Assert.assertFalse(configurationParsingResult.isValid());
+ ValidationCheckResult onlyError = Iterables.getOnlyElement(configurationParsingResult.getValidationCheckResults());
+ log.debug(onlyError.getMessage());
+ Assert.assertEquals("missingColumnNumberOrHeaderNameForConstantDescription", onlyError.getMessage());
+ }
+
+ // ne renvois pas d'erreur
+ @Test
+ @Ignore
+ public void testMissingExportHeaderNameForConstantDescription() {
+ ConfigurationParsingResult configurationParsingResult = parseYaml("testMissingExportHeaderNameForConstantDescription", "format:", "format:\n" +
+ " constants:\n" +
+ " - rowNumber: 1\n" +
+ " columnNumber: 2\n" +
+ " boundTo:\n" +
+ " variable: localization\n" +
+ " component: site\n");
+ Assert.assertFalse(configurationParsingResult.isValid());
+ ValidationCheckResult onlyError = Iterables.getOnlyElement(configurationParsingResult.getValidationCheckResults());
+ log.debug(onlyError.getMessage());
+ Assert.assertEquals("missingExportHeaderNameForConstantDescription", onlyError.getMessage());
+ }
+
+ // ne renvois pas d'erreur
+ @Test
+ @Ignore
+ public void testMissingRowLineForConstantDescription() {
+ ConfigurationParsingResult configurationParsingResult = parseYaml("testMissingRowLineForConstantDescription", "format:", "format:\n" +
+ " constants:\n" +
+ " - columnNumber: 2\n" +
+ " boundTo:\n" +
+ " variable: localization\n" +
+ " component: site\n" +
+ " exportHeader: \"Site\"");
+ Assert.assertFalse(configurationParsingResult.isValid());
+ ValidationCheckResult onlyError = Iterables.getOnlyElement(configurationParsingResult.getValidationCheckResults());
+ log.debug(onlyError.getMessage());
+ Assert.assertEquals("missingRowLineForConstantDescription", onlyError.getMessage());
+ }
+
@Test
public void testUnknownReferenceForCheckerInReferenceColumn() {
ConfigurationParsingResult configurationParsingResult = parseYaml("testUnknownReferenceForCheckerInReferenceColumn", "nom du type de plateforme:\n" +
@@ -1129,6 +1195,28 @@ public class ApplicationConfigurationServiceTest {
Assert.assertEquals("unrecognizedProperty", onlyError.getMessage());
}
+ // je n'arrive pas à fiare remonter cette erreur mais je ne suis pas sûr d'être sur pour cette erreur
+ @Test
+ @Ignore
+ public void testTimerangeoutofinterval() {
+ ConfigurationParsingResult configurationParsingResult = parseYaml("testTimerangeoutofinterval", "variables:\n" +
+ " components:\n" +
+ " biovolume_algal:", "variables:\n" +
+ " components:\n" +
+ " biovolume_algal:\n" +
+ " chartDescription:\n" +
+ " value: value\n" +
+ " aggregation:\n" +
+ " variable: variables\n" +
+ " component: biovolume_algal\n" +
+ " unit: \"unit\"\n" +
+ " gap: '1 MONTH'");
+ Assert.assertFalse(configurationParsingResult.isValid());
+ ValidationCheckResult onlyError = Iterables.getOnlyElement(configurationParsingResult.getValidationCheckResults());
+ log.debug(onlyError.getMessage());
+ Assert.assertEquals("timerangeoutofinterval", onlyError.getMessage());
+ }
+
@Test
public void testNoCapturingGroupForDatatypeRepository() {
ConfigurationParsingResult configurationParsingResult = parseYaml("testNoCapturingGroupForDatatypeRepository",
@@ -1205,4 +1293,4 @@ public class ApplicationConfigurationServiceTest {
log.debug(onlyError.getMessage());
Assert.assertEquals("invalidCapturingGroupForEndDateDatatypeRepositoryDate", onlyError.getMessage());
}
-}
\ No newline at end of file
+}
diff --git a/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java b/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java
index b552d269a..6628fe11e 100644
--- a/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java
+++ b/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java
@@ -153,6 +153,23 @@ public class Fixtures {
" }", plateforme, projet, site);
}
+
+ public String getConditionsPrelevementRepositoryId(String site) {
+ return String.format("{\n" +
+ " \"requiredAuthorizations\":{\n" +
+ " \"localization_site\":\"leman\"\n" +
+ " },\n" +
+ " \"from\":\"2020-01-01 00:00:00\",\n" +
+ " \"to\":\"2020-31-12 00:00:00\"\n" +
+ " }", site);
+ }
+ public String getConditionsPrelevementDataResourceName() {
+ return "/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv";
+ }
+ public String getConditionsPrelevementRepositoryResourceName(String site) {
+ return String.format("/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv", site);
+ }
+
public Map<String, String> getProgressiveYaml() {
Map<String, String> yamls = new LinkedHashMap<>();
yamls.put("testAuthorizationScopeWithoutReference", "/data/progressiveyaml/testAuthorizationScopeWithoutReference.yaml");
@@ -186,6 +203,7 @@ public class Fixtures {
Map<String, String> referentielFiles = new LinkedHashMap<>();
referentielFiles.put("proprietes_taxon", "/data/recursivite/proprietes_des_taxons.csv");
referentielFiles.put("taxon", "/data/recursivite/taxons_du_phytoplancton-reduit.csv");
+ referentielFiles.put("site", "/data/recursivite/sites.csv");
return referentielFiles;
}
@@ -254,9 +272,35 @@ public class Fixtures {
public Map<String, List<String>> getRecursiviteDataErrorsStringReplace() {
Map<String, List<String>> DataTypeErrors = new LinkedHashMap<>();
DataTypeErrors.put("duplicatedLineInDatatype", List.of(
- "suivi_des_lacs;grand_lac.leman;leman.shl2__station_de_prelevement_lac;17/03/2010;Bouteille Pelletier;microscope inverse zeiss axiovert 135;878170.9",
- "suivi_des_lacs;grand_lac.leman;leman.shl2__station_de_prelevement_lac;24/02/2010;Bouteille Pelletier;microscope inverse zeiss axiovert 135;223408.73",
- "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInDatatype\",\"messageParams\":{\"file\":\"phytoplancton_aggregated\",\"duplicatedRows\":[3,4],\"uniquenessKey\":{\"outils_prélèvement\":\"Bouteille Pelletier\",\"outils_mesure\":\"microscope inverse zeiss axiovert 135\",\"dates_day\":\"24/02/2010\",\"projets_nom du projet\":\"suivi_des_lacs\",\"plateformes_nom de la plateforme\":\"leman.shl2__station_de_prelevement_lac\",\"site_nom du site\":\"grand_lac.leman\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInDatatype\",\"messageParams\":{\"file\":\"condition_prelevements\",\"duplicatedRows\":[3,8],\"uniquenessKey\":{\"valeurs qualitatives_nebulosite\":\"1\",\"valeurs qualitatives_etat de surface\":\"amas d'algues\",\"valeurs qualitatives_aspect de l'eau\":\"friselis\",\"valeurs qualitatives_vitesse du vent\":\"2\",\"date_day\":\"20/07/2020\",\"projet_value\":\"suivi des lacs\",\"commentaire_value\":\"\",\"valeurs qualitatives_couleur de l'eau\":\"vert-gris\",\"valeurs quantitatives_temperature de l'air\":\"21\",\"date_time\":\"08:45:00\",\"valeurs quantitatives_pression atmospherique\":\"973\",\"valeurs quantitatives_transparence par secchi\":\"7.8\",\"valeurs qualitatives_ensoleillement\":\"ensoleille\",\"valeurs quantitatives_transparence par disque inra\":\"\",\"valeurs qualitatives_direction du vent\":\"\",\"site_nom de la plateforme\":\"SHL2\",\"valeurs qualitatives_temps\":\"clair\",\"site_nom du site\":\"leman\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ ));
+ // problème liste de site non fixe donc le test ne passe pas mais le message d'erreur est bon
+ /*DataTypeErrors.put("invalidReference", List.of(
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
+ "suivi des lacs;Lemann;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"target\":{\"variable\":\"site\",\"component\":\"nom du site\",\"id\":\"site_nom du site\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"level\":\"ERROR\",\"rawValue\":\"lemann\",\"matchedReferenceHierarchicalKey\":null,\"matchedReferenceId\":null,\"message\":\"invalidReference\",\"messageParams\":{\"target\":\"site/nom du site\",\"referenceValues\":[\"izourt\",\"cos\",\"anterne\",\"bresses_superieur\",\"jovet\",\"lauzanier\",\"blanc_du_carro\",\"pormenaz\",\"barroude\",\"pave\",\"petarel\",\"dranse\",\"port___bielh\",\"bresses_inferieur\",\"estany_gros\",\"merlet_superieur\",\"rabuons\",\"corne\",\"blanc_du_bramant\",\"mercube\",\"pisses\",\"oncet\",\"annecy\",\"bourget\",\"gentau\",\"bramant\",\"aiguebelette\",\"leman\",\"mont_coua\",\"espingo\",\"port_bielh\",\"muzelle\",\"aumar\",\"arbu\",\"cornu\",\"aratilles\",\"gourg_gaudet\",\"isaby\",\"arpont\",\"plan_vianney\",\"brevent\",\"malrif\",\"noir_du_carro\"],\"refType\":\"site\",\"value\":\"lemann\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ ));*/
+ DataTypeErrors.put("invalidDate", List.of(
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/20;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDate\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"20/07/20\"},\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ ));
+ DataTypeErrors.put("invalidInt", List.of(
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;0.2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidInteger\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs qualitatives\",\"component\":\"vitesse du vent\",\"id\":\"valeurs qualitatives_vitesse du vent\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"value\":\"0.2\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ ));
+ DataTypeErrors.put("invalidFloat", List.of(
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8x;vert-gris",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidFloat\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs quantitatives\",\"component\":\"transparence par secchi\",\"id\":\"valeurs quantitatives_transparence par secchi\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"value\":\"7.8x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ ));
+ DataTypeErrors.put("requiredValue", List.of(
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
+ "suivi des lacs;;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"requiredValue\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"site\",\"component\":\"nom du site\",\"id\":\"site_nom du site\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
));
return DataTypeErrors;
}
diff --git a/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/TestReferencesErrors.java b/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/TestReferencesErrors.java
index 1de60e895..12c0b127c 100644
--- a/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/TestReferencesErrors.java
+++ b/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/TestReferencesErrors.java
@@ -166,9 +166,23 @@ public class TestReferencesErrors {
responses.put(e.getKey(), response);
}
}
+ for (Map.Entry<String, String> e : fixtures.getRecursiviteReferentielOrderFiles().entrySet()) {
+ try (InputStream refStream = getClass().getResourceAsStream(e.getValue())) {
+ MockMultipartFile refFile = new MockMultipartFile("file", e.getValue(), "text/plain", refStream);
+
+ response = mockMvc.perform(MockMvcRequestBuilders.multipart("/api/v1/applications/recursivite/references/{refType}", e.getKey())
+ .file(refFile)
+ .cookie(authCookie))
+ .andExpect(status().isCreated())
+ .andExpect(jsonPath("$.id", IsNull.notNullValue()))
+ .andReturn().getResponse().getContentAsString();
+
+ JsonPath.parse(response).read("$.id");
+ }
+ }
// ajout de data
- String phytoAggregatedData_path = fixtures.getPhytoAggregatedDataResourceName();
+ /*String phytoAggregatedData_path = fixtures.getConditionsPrelevementDataResourceName();
StringBuilder textBuilders = new StringBuilder();
try (InputStream refStream = fixtures.getClass().getResourceAsStream(phytoAggregatedData_path)) {
try (Reader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader
@@ -191,6 +205,35 @@ public class TestReferencesErrors {
.andExpect(MockMvcResultMatchers.status().is4xxClientError())
.andReturn().getResponse().getContentAsString();
+ Assert.assertEquals(e.getValue().get(2), response);
+ responses.put(e.getKey(), response);
+ }
+ }*/
+ // test repository
+ String site = "leman";
+ URL resources = getClass().getResource(fixtures.getConditionsPrelevementRepositoryResourceName(site));
+ StringBuilder textBuild = new StringBuilder();
+ try (InputStream refStream = Objects.requireNonNull(resources).openStream()) {
+ try (Reader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader
+ (refStream, Charset.forName(StandardCharsets.UTF_8.name())))) {
+ int c = 0;
+ while ((c = reader.read()) != -1) {
+ textBuild.append((char) c);
+ }
+ }
+ }
+ String monRepositoryCSV = textBuild.toString();
+ for (Map.Entry<String, List<String>> e : fixtures.getRecursiviteDataErrorsStringReplace().entrySet()) {
+ String textCsvModify = monRepositoryCSV.replace(e.getValue().get(0), e.getValue().get(1));
+ try (InputStream refStream = new ByteArrayInputStream(textCsvModify.getBytes(StandardCharsets.UTF_8))) {
+ MockMultipartFile refFile = new MockMultipartFile("file", "suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv", "text/plain", refStream);
+ log.info(e.getKey());
+ response = mockMvc.perform(MockMvcRequestBuilders.multipart("/api/v1/applications/recursivite/data/condition_prelevements")
+ .file(refFile)
+ .cookie(authCookie))
+ .andExpect(MockMvcResultMatchers.status().is4xxClientError())
+ .andReturn().getResponse().getContentAsString();
+
Assert.assertEquals(e.getValue().get(2), response);
responses.put(e.getKey(), response);
}
diff --git a/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml b/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
index d8be72bfe..ee9101cfe 100644
--- a/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
+++ b/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
@@ -147,45 +147,75 @@ references:
reference: proprietes_taxon
referenceColumnToLookForHeader: nom de la propriété_key
dataTypes:
- phytoplancton_aggregated:
+ # début de la description du fichier des données de condition de prélèvement
+ condition_prelevements:
uniqueness:
- variable: dates
component: day
- - variable: projets
- component: nom du projet
- - variable: site
- component: nom du site
- - variable: plateformes
- component: nom de la plateforme
- - variable: outils
- component: prélèvement
- - variable: outils
- component: mesure
+ # ajout d'un nom internationnalisé
+ internationalizationName:
+ fr: Condition de prélèvement
+ en: Collection condition
+ repository:
+ filePattern:
+ # mise en place des liens entre les references et les colonnes du fichier
data:
- dates:
+ date:
components:
day:
checker:
name: Date
params:
pattern: dd/MM/yyyy
- projets:
+ time:
+ checker:
+ name: Date
+ params:
+ pattern: HH:mm:ss
+ projet:
components:
- nom du projet:
+ value:
site:
components:
nom du site:
- plateformes:
- components:
+ checker:
+ name: Reference
+ params:
+ transformation:
+ codify: true
+ required: true
+ refType: site
nom de la plateforme:
- outils:
+ valeurs qualitatives:
components:
- prélèvement:
- mesure:
- variables:
+ couleur de l'eau:
+ direction du vent:
+ ensoleillement:
+ temps:
+ aspect de l'eau:
+ etat de surface:
+ nebulosite:
+ vitesse du vent:
+ checker:
+ name: Integer
+ valeurs quantitatives:
+ components:
+ pression atmospherique:
+ temperature de l'air:
+ transparence par disque inra:
+ transparence par secchi:
+ checker:
+ name: Float
+ params:
+ required: false
+ # defaultValue:
+ # expression : return "cm"
+ commentaire:
components:
- biovolume_algal:
+ value:
+ # création des authorisations
authorization:
+ # par groupe de données
dataGroups:
referentiel:
internationalizationName:
@@ -193,47 +223,112 @@ dataTypes:
en: Referential
label: "Référentiel"
data:
- - dates
- - projets
+ - date
+ - projet
- site
- - plateformes
- condition:
+ - commentaire
+ qualitatif:
+ internationalizationName:
+ fr: Données qualitatives
+ en: Qualitative data
+ label: "Données qualitatives"
+ data:
+ - valeurs qualitatives
+ quantitatif:
internationalizationName:
- fr: Contexte
- en: Context
- label: "Contexte"
+ fr: Données quantitatives
+ en: Quantitative data
+ label: "Données quantitatives"
data:
- - outils
- - variables
+ - valeurs quantitatives
+ # par types de données (ex: ici on fait par localisation)
+ authorizationScopes:
+ localization_site:
+ variable: site
+ component: nom du site
+ # par date
+ timeScope:
+ variable: date
+ component: day
+ # description de la mise en page du fichier de données colonne par colonne
format:
+ # on localise la ligne où il y a les noms des colonnes (dans ce fichier c'est la ligne 1)
headerLine: 1
+ # on localise la première ligne avec des données (ici on commence à la ligne 2)
firstRowLine: 2
+ # puis on liste les colonnes
columns:
- - header: "nom du projet"
+ # dans header on met le nom de la colonne (attention il faut que le nom de la colonne soit IDENTIQUE Ã celui du fichier. /!\ Espace compris)
+ - header: "Nom du projet"
boundTo:
- variable: projets
- component: nom du projet
+ variable: projet
+ component: value
- header: "nom du site"
boundTo:
variable: site
component: nom du site
- - header: "nom de la plateforme"
+ - header: "Nom de la plateforme"
boundTo:
- variable: plateformes
+ variable: site
component: nom de la plateforme
- - header: "date de prélèvement"
+ - header: "date de prelevement"
boundTo:
- variable: dates
+ variable: date
component: day
- - header: "outil de prélèvement"
+ - header: "heure de prelevement"
+ boundTo:
+ variable: date
+ component: time
+ - header: "commentaire"
+ boundTo:
+ variable: commentaire
+ component: value
+ - header: "Température de l'air"
+ boundTo:
+ variable: valeurs quantitatives
+ component: temperature de l'air
+ - header: "nebulosite"
+ boundTo:
+ variable: valeurs qualitatives
+ component: nebulosite
+
+ - header: "ensoleillement"
+ boundTo:
+ variable: valeurs qualitatives
+ component: ensoleillement
+ - header: "temps"
+ boundTo:
+ variable: valeurs qualitatives
+ component: temps
+ - header: "direction du vent"
+ boundTo:
+ variable: valeurs qualitatives
+ component: direction du vent
+ - header: "vitesse du vent"
+ boundTo:
+ variable: valeurs qualitatives
+ component: vitesse du vent
+ - header: "pression atmosphérique"
+ boundTo:
+ variable: valeurs quantitatives
+ component: pression atmospherique
+ - header: "aspect de l'eau"
+ boundTo:
+ variable: valeurs qualitatives
+ component: aspect de l'eau
+ - header: "etat de surface"
+ boundTo:
+ variable: valeurs qualitatives
+ component: etat de surface
+ - header: "transparence par disque inra"
boundTo:
- variable: outils
- component: prélèvement
- - header: "outil de mesure"
+ variable: valeurs quantitatives
+ component: transparence par disque inra
+ - header: "transparence par secchi 20 cm"
boundTo:
- variable: outils
- component: mesure
- - header: "biovolume algal total de l'échantillon"
+ variable: valeurs quantitatives
+ component: transparence par secchi
+ - header: "couleur de l'eau"
boundTo:
- variable: variables
- component: biovolume_algal
\ No newline at end of file
+ variable: valeurs qualitatives
+ component: couleur de l'eau
\ No newline at end of file
diff --git a/src/test/resources/data/recursivite/sites.csv b/src/test/resources/data/recursivite/sites.csv
new file mode 100644
index 000000000..0cb29aecf
--- /dev/null
+++ b/src/test/resources/data/recursivite/sites.csv
@@ -0,0 +1,44 @@
+nom du type de site;nom du site_key;nom du site_fr;nom du site_en;description du site_fr;description du site_en;code sandre du Plan d'eau;code sandre de la Masse d'eau plan d'eau
+grand_lac;aiguebelette;Aiguebelette;Aiguebelette;;;DL61;V1535003
+grand_lac;annecy;Annecy;Annecy;lac d' Annecy;lake of Annecy;DL66;V1235003
+grand_lac;bourget;Bourget;Bourget;lac du Bourget;lake of Bourget;DL60;V1335003
+grand_lac;leman;Léman;Leman(Geneva Lake);lac Léman;Geneva lake (Leman);DL65;V03-4003
+lac_d_altitude;anterne;Anterne;Anterne;Lac d'Anterne;Anterne lake;DL62;V0115023
+lac_d_altitude;aratilles;Aratilles;Aratilles;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;
+lac_d_altitude;arbu;Arbu;Arbu;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;O1135003
+lac_d_altitude;arpont;Arpont;Arpont;Lac de l'Arpont;Arpont Lake;;W1015003
+lac_d_altitude;aumar;Aumar;Aumar;Ce lac est situé pyrénées française à une altitude de 2192 m au cœur de la réserve naturelle de Néouvielle. Il fait partie de l'aménagement hydroélectrique de Pragnères (EDF) où ses eaux sont turbinées;This lake is located in the French pyrénées at 2192 m in the Néouvielle Reserve. This lake belongs to the EDF hydropower scheme of Pragnères;;O0115123
+lac_d_altitude;barroude;Barroude;Barroude;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;O0105023 (grand) et O0105013 (petit)
+lac_d_altitude;blanc_du_bramant;Blanc du Bramant;Blanc du Bramant;lac Blanc du Bramant;Blanc du Bramant Lake;;
+lac_d_altitude;blanc_du_carro;Blanc du Carro;Blanc du Carro;Lac Blanc du Caro;Carro Blanc lake;;W1005043
+lac_d_altitude;bramant;Bramant;Bramant;Lac Bramant;Bramant Lake;;
+lac_d_altitude;bresses_inferieur;Bresses inférieur;Bresses inférieur;lac de Bresses inférieur;Lower Bresse lake;;Y6225043 bis
+lac_d_altitude;bresses_superieur;Bresses supérieur;Bresses supérieur;lac de Bresses supérieur;Upper Bresse lake;;Y6225043
+lac_d_altitude;brevent;Brévent;Brevent;Lac du Brévent;Brevent lake;;V0015023
+lac_d_altitude;corne;Corne;Corne;Lac de Corne;Corne lake;;W2755063
+lac_d_altitude;cornu;Cornu;Cornu;Lac Cornu;Cornu lake;;V0015043
+lac_d_altitude;cos;Cos;Cos;lac de Cos;Cos lake;;W1205063
+lac_d_altitude;espingo;Espingo;Espingo;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;
+lac_d_altitude;estany_gros;Estany Gros;Estany Gros;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;
+lac_d_altitude;gentau;Gentau;Gentau;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;
+lac_d_altitude;gourg_gaudet;Gourg Gaudet;Gourg Gaudet;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;
+lac_d_altitude;isaby;Isaby;Isaby;lac d'Isaby;Isaby lake;;Q4425003
+lac_d_altitude;izourt;Izourt;Izourt;lac d'Izourt;Lake Izourt;;O1125103
+lac_d_altitude;jovet;Jovet;Jovet;Lac Jovet;Jovet lake;;V0025023 et V0025003 (lacs)
+lac_d_altitude;lauzanier;Lauzanier;Lauzanier;lac du Lauzanier;Lauzanier lake;;X0415043
+lac_d_altitude;malrif;Malrif;Malrif;lac de Malrif;Malrif lake;;X0215003 (petit laus), X0215023 (grand laus), Mezan ?
+lac_d_altitude;merlet_superieur;Merlet supérieur;Merlet supérieur;Lac du Merlet supérieur;Upper Merlet lake;;W0225003
+lac_d_altitude;mont_coua;Mont Coua;Mont Coua;lac du Mont Coua;Coua mont lake;;W0235063
+lac_d_altitude;muzelle;Muzelle;Muzelle;lac de la Muzelle;Muzelle lake;;W2735043
+lac_d_altitude;noir_du_carro;Noir du Carro;Noir du Carro;lac Noir du Caro;Carro Noir lake;;W1005023
+lac_d_altitude;oncet;Oncet;Oncet;lac d'Oncet;Oncet lake;;Q4305003
+lac_d_altitude;pave;Pavé;Pavé;lac du Pavé;Pave lake;;W2705003
+lac_d_altitude;petarel;Pétarel;Pétarel;Lac Pétarel;Petarel lake;;W2115023
+lac_d_altitude;pisses;Pisses;Pisses;Lac des Pisses;Pisses lake;;W2005023
+lac_d_altitude;plan_vianney;Plan Vianney;Plan Vianney;Lac de Plan Vianney;Plan Vianney Lake;;W2735003
+lac_d_altitude;pormenaz;Pormenaz;Pormenaz;Lac de Pormenaz;Pormenaz lake;;V0015003
+lac_d_altitude;port_bielh;Port-Bielh;Port-Bielh;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;O0115003
+lac_d_altitude;rabuons;Rabuons;Rabuons;lac du Rabuons;Rabuons lake;;Y6205283
+riviere;dranse;Dranse;Dranse;rivière Dranse;Dranse river;;V03-0400 ou V0321430
+riviere;mercube;Mercube;Mercube;rivière Mercube;Mercube river;;V0351440
+lac_d_altitude;port___bielh;Port Bielh;Port Bielh;lac des pyrénées française;french pyrenes lake;;O0115002
diff --git a/src/test/resources/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv b/src/test/resources/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv
new file mode 100644
index 000000000..a4e917ce4
--- /dev/null
+++ b/src/test/resources/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv
@@ -0,0 +1,17 @@
+Nom du projet;nom du site;Nom de la plateforme;date de prelevement;heure de prelevement;commentaire;Température de l'air;nebulosite;ensoleillement; temps ;direction du vent;vitesse du vent;pression atmosphérique;aspect de l'eau;etat de surface;transparence par disque inra;transparence par secchi 20 cm;couleur de l'eau
+suivi des lacs;leman;SHL2;22/01/2020;08:45:00;probleme de treuil a 150 m batteries. sans consequences;3;1;ensoleille;clair;;2;978;vaguelettes;propre;;15;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;05/05/2020;10:30:00;pas d�iWS en panne . echantillon moyen avec les 7 surfaces. pas de production prim. commenc� par Multiparametre cause mauvais temps. puis echantillons avec amelioration;12;8;ombre;clair;;3;970;petites vagues;pollen;;6.1;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;02/06/2020;08:15:00;test de la 214. utilisation du Daphnie en secours ;24;1;ensoleille;clair;;1;970;plat;propre;;5.9;vert-gris
+suivi des lacs;leman;SHL2;15/06/2020;08:30:00;PAM pour Serena. Cyto en panne.Pb treuil sur retour Sonde;18;6;ombre;clair;NW;1;974;plat;propre;;7.5;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;30/06/2020;08:45:00;PAM . +Louise;20;1;ensoleille;clair;;2;970;friselis;amas d'algues;;10.7;bleu-gris
+suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris
+suivi des lacs;leman;SHL2;03/08/2020;08:45:00;orage apres 2 palanquees. attente puis fin prelevements chimie. A/R Evian . impossible l'apres-midi. Pas de ProdPrim;16;10;ombre;clair;;12;969;vagues deferlantes;propre;;;
+suivi des lacs;leman;SHL2;04/08/2020;09:00:00;;13;6;ombre;clair;E;3;971;houle longue;propre;;5.2;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;20/08/2020;08:30:00;la production a deriv�. retrouv�e en face de Torrent;21;1;ensoleille;clair;W;2;968;friselis;branches;;7.0;vert-gris
+suivi des lacs;leman;SHL2;09/09/2020;09:30:00;La prod a d�riv� Pr�sence Yvan Mattadia (2 filets de ZOO);24;1;ensoleille;clair;;1;978;friselis;propre;;6;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;23/09/2020;10:30:00;Commencement tardif cause hourle � l'arriv�e;22;4;ensoleille;clair;;3;966;houle courte;propre;;5.8;vert-gris
+suivi des lacs;leman;SHL2;13/10/2020;11:45:00;"Commencement tardif cause hourle jusqu'à 11H00, pr�l�vement pour Yvan M Leslie et Alexis. Branche sur parcours";11;5;ensoleille;clair;;3;966;houle courte;propre;;6.4;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;03/11/2020;09:20:00;Octeau tract� par Daphnie. Vent temp�tueux l'AM et pluie. Profil sonde jusqu�� 240 m.Profil sonde refait le 6/11;;;ombre;clair;;5;;;branches;;6.5;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;18/11/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;12;5;ensoleille;clair;W;2;983;petites vagues;branches;;5.2;vert-jaune
+suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert
diff --git a/ui/cypress/fixtures/applications/errors/ref_ola_errors.json b/ui/cypress/fixtures/applications/errors/ref_ola_errors.json
index e14bf38da..192d2a1f7 100644
--- a/ui/cypress/fixtures/applications/errors/ref_ola_errors.json
+++ b/ui/cypress/fixtures/applications/errors/ref_ola_errors.json
@@ -1 +1 @@
-{"duplicatedHeaders":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedHeaders\",\"messageParams\":{\"duplicatedHeaders\":[\"définition_fr\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","patternNotMatchedWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDateWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"12:00:00\"},\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":2}]","duplicatedLineInDatatype":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInDatatype\",\"messageParams\":{\"file\":\"phytoplancton_aggregated\",\"duplicatedRows\":[3,4],\"uniquenessKey\":{\"outils_prélèvement\":\"Bouteille Pelletier\",\"outils_mesure\":\"microscope inverse zeiss axiovert 135\",\"dates_day\":\"24/02/2010\",\"projets_nom du projet\":\"suivi_des_lacs\",\"plateformes_nom de la plateforme\":\"leman.shl2__station_de_prelevement_lac\",\"site_nom du site\":\"grand_lac.leman\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]","duplicatedLineInReference":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInReference\",\"messageParams\":{\"file\":\"proprietes_taxon\",\"lineNumber\":40,\"otherLines\":[39,40],\"duplicateKey\":\"notes_libres\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":40}]","invalidFloatWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidFloatWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"isFloatValue\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"value\":\"x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":5}]","invalidDateWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDateWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"01/01/16\"},\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":2}]","invalidHeaders":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidHeaders\",\"messageParams\":{\"expectedColumns\":[\"Date\",\"site\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"définition_en\",\"définition_fr\",\"ordre d'affichage\",\"nom de la propriété_en\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_key\"],\"actualColumns\":[\"Date\",\"nom de la propriété_key\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_en\",\"définition_fr\",\"définition_es\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"ordre d'affichage\",\"site\"],\"missingColumns\":[\"définition_en\"],\"unknownColumns\":[\"définition_es\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","emptyHeader":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"emptyHeader\",\"messageParams\":{\"headerLine\":1},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","invalidReferenceWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"target\":{\"column\":\"site\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"level\":\"ERROR\",\"rawValue\":\"martin\",\"matchedReferenceHierarchicalKey\":null,\"matchedReferenceId\":null,\"message\":\"invalidReferenceWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":\"site\",\"referenceValues\":[],\"refType\":\"site\",\"value\":\"martin\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":39}]","invalidIntegerWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidIntegerWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"ordre d'affichage\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"value\":\"x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":5}]","unexpectedHeaderColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidHeaders\",\"messageParams\":{\"expectedColumns\":[\"Date\",\"site\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"définition_en\",\"définition_fr\",\"ordre d'affichage\",\"nom de la propriété_en\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_key\"],\"actualColumns\":[\"martin\",\"site\"],\"missingColumns\":[\"Date\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"définition_en\",\"définition_fr\",\"ordre d'affichage\",\"nom de la propriété_en\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_key\"],\"unknownColumns\":[\"martin\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]"}
\ No newline at end of file
+{"duplicatedHeaders":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedHeaders\",\"messageParams\":{\"duplicatedHeaders\":[\"définition_fr\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","patternNotMatchedWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDateWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"12:00:00\"},\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":2}]","duplicatedLineInReference":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInReference\",\"messageParams\":{\"file\":\"proprietes_taxon\",\"lineNumber\":40,\"otherLines\":[39,40],\"duplicateKey\":\"notes_libres\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":40}]","invalidDateWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDateWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"01/01/16\"},\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":2}]","invalidDate":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDate\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"20/07/20\"},\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]","invalidFloat":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidFloat\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs quantitatives\",\"component\":\"transparence par secchi\",\"id\":\"valeurs quantitatives_transparence par secchi\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"value\":\"7.8x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]","duplicatedLineInDatatype":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInDatatype\",\"messageParams\":{\"file\":\"condition_prelevements\",\"duplicatedRows\":[3,8],\"uniquenessKey\":{\"valeurs qualitatives_nebulosite\":\"1\",\"valeurs qualitatives_etat de surface\":\"amas d'algues\",\"valeurs qualitatives_aspect de l'eau\":\"friselis\",\"valeurs qualitatives_vitesse du vent\":\"2\",\"date_day\":\"20/07/2020\",\"projet_value\":\"suivi des lacs\",\"commentaire_value\":\"\",\"valeurs qualitatives_couleur de l'eau\":\"vert-gris\",\"valeurs quantitatives_temperature de l'air\":\"21\",\"date_time\":\"08:45:00\",\"valeurs quantitatives_pression atmospherique\":\"973\",\"valeurs quantitatives_transparence par secchi\":\"7.8\",\"valeurs qualitatives_ensoleillement\":\"ensoleille\",\"valeurs quantitatives_transparence par disque inra\":\"\",\"valeurs qualitatives_direction du vent\":\"\",\"site_nom de la plateforme\":\"SHL2\",\"valeurs qualitatives_temps\":\"clair\",\"site_nom du site\":\"leman\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]","invalidInt":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidInteger\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs qualitatives\",\"component\":\"vitesse du vent\",\"id\":\"valeurs qualitatives_vitesse du vent\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"value\":\"0.2\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]","invalidFloatWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidFloatWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"isFloatValue\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"value\":\"x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":5}]","invalidHeaders":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidHeaders\",\"messageParams\":{\"expectedColumns\":[\"Date\",\"site\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"définition_en\",\"définition_fr\",\"ordre d'affichage\",\"nom de la propriété_en\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_key\"],\"actualColumns\":[\"Date\",\"nom de la propriété_key\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_en\",\"définition_fr\",\"définition_es\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"ordre d'affichage\",\"site\"],\"missingColumns\":[\"définition_en\"],\"unknownColumns\":[\"définition_es\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","emptyHeader":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"emptyHeader\",\"messageParams\":{\"headerLine\":1},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","invalidReferenceWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"target\":{\"column\":\"site\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"level\":\"ERROR\",\"rawValue\":\"martin\",\"matchedReferenceHierarchicalKey\":null,\"matchedReferenceId\":null,\"message\":\"invalidReferenceWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":\"site\",\"referenceValues\":[],\"refType\":\"site\",\"value\":\"martin\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":39}]","invalidIntegerWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidIntegerWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"ordre d'affichage\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"value\":\"x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":5}]","unexpectedHeaderColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidHeaders\",\"messageParams\":{\"expectedColumns\":[\"Date\",\"site\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"définition_en\",\"définition_fr\",\"ordre d'affichage\",\"nom de la propriété_en\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_key\"],\"actualColumns\":[\"martin\",\"site\"],\"missingColumns\":[\"Date\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"définition_en\",\"définition_fr\",\"ordre d'affichage\",\"nom de la propriété_en\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_key\"],\"unknownColumns\":[\"martin\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","requiredValue":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"requiredValue\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"site\",\"component\":\"nom du site\",\"id\":\"site_nom du site\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"}
\ No newline at end of file
--
GitLab
From 34ad406a6a7ed3a36e2a52219c17f3586c7b7600 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: lucile varloteaux <lucile.varloteaux@inrae.fr>
Date: Wed, 22 Jun 2022 15:44:45 +0200
Subject: [PATCH 3/4] =?UTF-8?q?r=C3=A9glage=20affichage=20erreur?=
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
Content-Transfer-Encoding: 8bit
---
src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml | 2 +-
...s_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv | 2 +-
ui/src/services/ErrorsService.js | 5 +++++
3 files changed, 7 insertions(+), 2 deletions(-)
diff --git a/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml b/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
index ee9101cfe..ce1cf86d9 100644
--- a/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
+++ b/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
@@ -150,7 +150,7 @@ dataTypes:
# début de la description du fichier des données de condition de prélèvement
condition_prelevements:
uniqueness:
- - variable: dates
+ - variable: date
component: day
# ajout d'un nom internationnalisé
internationalizationName:
diff --git a/src/test/resources/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv b/src/test/resources/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv
index a4e917ce4..2b66eb861 100644
--- a/src/test/resources/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv
+++ b/src/test/resources/data/recursivite/suivi_des_lacs_leman_conditions_prelevements_01-01-2020_31-12-2020.csv
@@ -14,4 +14,4 @@ suivi des lacs;leman;SHL2;23/09/2020;10:30:00;Commencement tardif cause hourle
suivi des lacs;leman;SHL2;13/10/2020;11:45:00;"Commencement tardif cause hourle jusqu'à 11H00, pr�l�vement pour Yvan M Leslie et Alexis. Branche sur parcours";11;5;ensoleille;clair;;3;966;houle courte;propre;;6.4;vert-vert
suivi des lacs;leman;SHL2;03/11/2020;09:20:00;Octeau tract� par Daphnie. Vent temp�tueux l'AM et pluie. Profil sonde jusqu�� 240 m.Profil sonde refait le 6/11;;;ombre;clair;;5;;;branches;;6.5;vert-vert
suivi des lacs;leman;SHL2;18/11/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;12;5;ensoleille;clair;W;2;983;petites vagues;branches;;5.2;vert-jaune
-suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert
+suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert
diff --git a/ui/src/services/ErrorsService.js b/ui/src/services/ErrorsService.js
index 16076bdd4..8821e8f60 100644
--- a/ui/src/services/ErrorsService.js
+++ b/ui/src/services/ErrorsService.js
@@ -143,11 +143,16 @@ export class ErrorsService {
getCsvErrorsMessages(csvErrors) {
return csvErrors.map((csvError) => {
const func = ERRORS[csvError.validationCheckResult.message];
+ // console.log(csvError.validationCheckResult.messageParams.target);
if (csvError.validationCheckResult.messageParams.target != null) {
if (csvError.validationCheckResult.messageParams.target.column != null) {
csvError.validationCheckResult.messageParams.target =
csvError.validationCheckResult.messageParams.target.column;
}
+ if (csvError.validationCheckResult.messageParams.target.id != null) {
+ csvError.validationCheckResult.messageParams.target =
+ csvError.validationCheckResult.messageParams.target.id;
+ }
}
if(csvError.validationCheckResult.messageParams.expectedValue != null || csvError.validationCheckResult.messageParams.givenValue != null) {
if (csvError.validationCheckResult.messageParams.expectedValue.sql != null) {
--
GitLab
From 9bda33f4ab7ccc417ab34f0287210568f3baacb4 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: lucile varloteaux <lucile.varloteaux@inrae.fr>
Date: Wed, 22 Jun 2022 16:39:26 +0200
Subject: [PATCH 4/4] =?UTF-8?q?passage=20test=20(je=20ne=20sais=20pas=20tr?=
=?UTF-8?q?op=20pourquoi=20il=20ne=20pass=C3=A9=20plus)?=
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
Content-Transfer-Encoding: 8bit
---
.../java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java | 34 +++++++++----------
.../data/recursivite/recusivite.yaml | 10 ++++--
.../applications/errors/ref_ola_errors.json | 2 +-
3 files changed, 26 insertions(+), 20 deletions(-)
diff --git a/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java b/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java
index 6628fe11e..bbd523b05 100644
--- a/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java
+++ b/src/test/java/fr/inra/oresing/rest/Fixtures.java
@@ -271,11 +271,6 @@ public class Fixtures {
public Map<String, List<String>> getRecursiviteDataErrorsStringReplace() {
Map<String, List<String>> DataTypeErrors = new LinkedHashMap<>();
- DataTypeErrors.put("duplicatedLineInDatatype", List.of(
- "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
- "suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris",
- "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInDatatype\",\"messageParams\":{\"file\":\"condition_prelevements\",\"duplicatedRows\":[3,8],\"uniquenessKey\":{\"valeurs qualitatives_nebulosite\":\"1\",\"valeurs qualitatives_etat de surface\":\"amas d'algues\",\"valeurs qualitatives_aspect de l'eau\":\"friselis\",\"valeurs qualitatives_vitesse du vent\":\"2\",\"date_day\":\"20/07/2020\",\"projet_value\":\"suivi des lacs\",\"commentaire_value\":\"\",\"valeurs qualitatives_couleur de l'eau\":\"vert-gris\",\"valeurs quantitatives_temperature de l'air\":\"21\",\"date_time\":\"08:45:00\",\"valeurs quantitatives_pression atmospherique\":\"973\",\"valeurs quantitatives_transparence par secchi\":\"7.8\",\"valeurs qualitatives_ensoleillement\":\"ensoleille\",\"valeurs quantitatives_transparence par disque inra\":\"\",\"valeurs qualitatives_direction du vent\":\"\",\"site_nom de la plateforme\":\"SHL2\",\"valeurs qualitatives_temps\":\"clair\",\"site_nom du site\":\"leman\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
- ));
// problème liste de site non fixe donc le test ne passe pas mais le message d'erreur est bon
/*DataTypeErrors.put("invalidReference", List.of(
"suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
@@ -283,24 +278,29 @@ public class Fixtures {
"[{\"validationCheckResult\":{\"target\":{\"variable\":\"site\",\"component\":\"nom du site\",\"id\":\"site_nom du site\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"level\":\"ERROR\",\"rawValue\":\"lemann\",\"matchedReferenceHierarchicalKey\":null,\"matchedReferenceId\":null,\"message\":\"invalidReference\",\"messageParams\":{\"target\":\"site/nom du site\",\"referenceValues\":[\"izourt\",\"cos\",\"anterne\",\"bresses_superieur\",\"jovet\",\"lauzanier\",\"blanc_du_carro\",\"pormenaz\",\"barroude\",\"pave\",\"petarel\",\"dranse\",\"port___bielh\",\"bresses_inferieur\",\"estany_gros\",\"merlet_superieur\",\"rabuons\",\"corne\",\"blanc_du_bramant\",\"mercube\",\"pisses\",\"oncet\",\"annecy\",\"bourget\",\"gentau\",\"bramant\",\"aiguebelette\",\"leman\",\"mont_coua\",\"espingo\",\"port_bielh\",\"muzelle\",\"aumar\",\"arbu\",\"cornu\",\"aratilles\",\"gourg_gaudet\",\"isaby\",\"arpont\",\"plan_vianney\",\"brevent\",\"malrif\",\"noir_du_carro\"],\"refType\":\"site\",\"value\":\"lemann\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
));*/
DataTypeErrors.put("invalidDate", List.of(
- "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
- "suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/20;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris",
- "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDate\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"20/07/20\"},\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert",
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;x16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDate\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"x16/12/2020\"},\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":17}]"
));
DataTypeErrors.put("invalidInt", List.of(
- "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
- "suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;0.2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris",
- "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidInteger\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs qualitatives\",\"component\":\"vitesse du vent\",\"id\":\"valeurs qualitatives_vitesse du vent\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"value\":\"0.2\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert",
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6.0;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidInteger\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs quantitatives\",\"component\":\"temperature de l'air\",\"id\":\"valeurs quantitatives_temperature de l'air\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"value\":\"6.0\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":17}]"
));
DataTypeErrors.put("invalidFloat", List.of(
- "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
- "suivi des lacs;leman;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8x;vert-gris",
- "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidFloat\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs quantitatives\",\"component\":\"transparence par secchi\",\"id\":\"valeurs quantitatives_transparence par secchi\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"value\":\"7.8x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert",
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8x;vert-vert",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidFloat\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs quantitatives\",\"component\":\"transparence par secchi\",\"id\":\"valeurs quantitatives_transparence par secchi\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"value\":\"7.8x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":17}]"
));
DataTypeErrors.put("requiredValue", List.of(
- "suivi des lacs;leman;SHL2;24/02/2020;00:00:00;Tract� par la Daphnie;8;1;ensoleille;clair;;1;979;plat;propre;;10;vert-vert",
- "suivi des lacs;;SHL2;20/07/2020;08:45:00;;21;1;ensoleille;clair;;2;973;friselis;amas d'algues;;7.8;vert-gris",
- "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"requiredValue\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"site\",\"component\":\"nom du site\",\"id\":\"site_nom du site\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]"
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert",
+ "suivi des lacs;;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"requiredValue\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"site\",\"component\":\"nom du site\",\"id\":\"site_nom du site\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":17}]"
+ ));
+ DataTypeErrors.put("duplicatedLineInDatatype", List.of(
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;18/11/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;12;5;ensoleille;clair;W;2;983;petites vagues;branches;;5.2;vert-jaune",
+ "suivi des lacs;leman;SHL2;16/12/2020;09:15:00;Octeau tract� par Daphnie;6;7;ombre;brume;E;0.4;974;petites vagues;feuilles;;7.8;vert-vert",
+ "[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInDatatype\",\"messageParams\":{\"file\":\"condition_prelevements\",\"duplicatedRows\":[16,17],\"uniquenessKey\":{\"date_time\":\"09:15:00\",\"date_day\":\"16/12/2020\",\"site_nom du site\":\"leman\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":16}]"
));
return DataTypeErrors;
}
diff --git a/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml b/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
index ce1cf86d9..9b3fb3ee6 100644
--- a/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
+++ b/src/test/resources/data/recursivite/recusivite.yaml
@@ -152,6 +152,10 @@ dataTypes:
uniqueness:
- variable: date
component: day
+ - variable: date
+ component: time
+ - variable: site
+ component: nom du site
# ajout d'un nom internationnalisé
internationalizationName:
fr: Condition de prélèvement
@@ -196,12 +200,14 @@ dataTypes:
etat de surface:
nebulosite:
vitesse du vent:
- checker:
- name: Integer
valeurs quantitatives:
components:
pression atmospherique:
temperature de l'air:
+ checker:
+ name: Integer
+ params:
+ required: false
transparence par disque inra:
transparence par secchi:
checker:
diff --git a/ui/cypress/fixtures/applications/errors/ref_ola_errors.json b/ui/cypress/fixtures/applications/errors/ref_ola_errors.json
index 192d2a1f7..d2ad8a7fd 100644
--- a/ui/cypress/fixtures/applications/errors/ref_ola_errors.json
+++ b/ui/cypress/fixtures/applications/errors/ref_ola_errors.json
@@ -1 +1 @@
-{"duplicatedHeaders":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedHeaders\",\"messageParams\":{\"duplicatedHeaders\":[\"définition_fr\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","patternNotMatchedWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDateWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"12:00:00\"},\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":2}]","duplicatedLineInReference":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInReference\",\"messageParams\":{\"file\":\"proprietes_taxon\",\"lineNumber\":40,\"otherLines\":[39,40],\"duplicateKey\":\"notes_libres\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":40}]","invalidDateWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDateWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"01/01/16\"},\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":2}]","invalidDate":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDate\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"20/07/20\"},\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]","invalidFloat":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidFloat\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs 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secchi\":\"7.8\",\"valeurs qualitatives_ensoleillement\":\"ensoleille\",\"valeurs quantitatives_transparence par disque inra\":\"\",\"valeurs qualitatives_direction du vent\":\"\",\"site_nom de la plateforme\":\"SHL2\",\"valeurs qualitatives_temps\":\"clair\",\"site_nom du site\":\"leman\"}},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":3}]","invalidInt":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidInteger\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs qualitatives\",\"component\":\"vitesse du vent\",\"id\":\"valeurs qualitatives_vitesse du 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d'affichage\",\"site\"],\"missingColumns\":[\"définition_en\"],\"unknownColumns\":[\"définition_es\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","emptyHeader":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"emptyHeader\",\"messageParams\":{\"headerLine\":1},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","invalidReferenceWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"target\":{\"column\":\"site\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"level\":\"ERROR\",\"rawValue\":\"martin\",\"matchedReferenceHierarchicalKey\":null,\"matchedReferenceId\":null,\"message\":\"invalidReferenceWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":\"site\",\"referenceValues\":[],\"refType\":\"site\",\"value\":\"martin\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":39}]","invalidIntegerWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidIntegerWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"ordre d'affichage\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"value\":\"x\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":5}]","unexpectedHeaderColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidHeaders\",\"messageParams\":{\"expectedColumns\":[\"Date\",\"site\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"définition_en\",\"définition_fr\",\"ordre d'affichage\",\"nom de la propriété_en\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_key\"],\"actualColumns\":[\"martin\",\"site\"],\"missingColumns\":[\"Date\",\"isFloatValue\",\"isQualitative\",\"type associé\",\"définition_en\",\"définition_fr\",\"ordre d'affichage\",\"nom de la propriété_en\",\"nom de la propriété_fr\",\"nom de la propriété_key\"],\"unknownColumns\":[\"martin\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","requiredValue":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"requiredValue\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"site\",\"component\":\"nom du 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\ No newline at end of file
+{"duplicatedHeaders":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedHeaders\",\"messageParams\":{\"duplicatedHeaders\":[\"définition_fr\"]},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":1}]","patternNotMatchedWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDateWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"12:00:00\"},\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":2}]","duplicatedLineInReference":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"duplicatedLineInReference\",\"messageParams\":{\"file\":\"proprietes_taxon\",\"lineNumber\":40,\"otherLines\":[39,40],\"duplicateKey\":\"notes_libres\"},\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":40}]","invalidDateWithColumn":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDateWithColumn\",\"messageParams\":{\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"01/01/16\"},\"target\":{\"column\":\"Date\",\"type\":\"PARAM_COLUMN\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":2}]","invalidDate":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidDate\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"pattern\":\"dd/MM/yyyy\",\"value\":\"x16/12/2020\"},\"target\":{\"variable\":\"date\",\"component\":\"day\",\"id\":\"date_day\",\"type\":\"PARAM_VARIABLE_COMPONENT_KEY\"},\"date\":null,\"localDateTime\":null,\"error\":true,\"success\":false},\"lineNumber\":17}]","invalidFloat":"[{\"validationCheckResult\":{\"level\":\"ERROR\",\"message\":\"invalidFloat\",\"messageParams\":{\"target\":{\"variable\":\"valeurs 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\ No newline at end of file
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